Enfoques genómicos para identificar genes implicados en trastornos psiquiátricos importantes
Recientemente, establecimos un novedoso nodo español para genética psiquiátrica con clínicos de la Fundación Jiménez Díaz, y fundamos el Grupo Maníaco de Madrid (MadManic) que reúne genetistas, bioinformáticos y psiquiatras con el objetivo de desarrollar herramientas traslacionales novedosas aplicadas a la práctica clínica que combinen el riesgo genómico de matrices de alto rendimiento, registros digitales de dispositivos de evaluación ecológica momentánea (EMA) y enfoques de aprendizaje automático. Establecimos una de las cohortes más grandes de España de pacientes psiquiátricos (trastorno bipolar, suicidio y esquizofrenia) y controles con un biobanco de biomuestras (ADN, ARN y plasma) para genómica, transcriptómica y metabolómica. Paralelamente, dependemos de historiales clínicos de un protocolo electrónico ampliado centralizado entre hospitales psiquiátricos que recopilan datos sobre la presentación clínica y la historia clínica de los pacientes, la respuesta a la medicación y varias escalas clínicas y conductuales. Estos instrumentos se utilizan para enfoques novedosos en psiquiatría traslacional.
Salud y Bienestar
Sobre el proyecto
Nuestra experiencia en análisis de datos de alto rendimiento ha identificado varios genes en trastornos psiquiátricos. En los últimos años, hemos adoptado, en una cohorte de familias con múltiples miembros afectados por trastorno bipolar, una combinación de métodos computacionales tanto en genómica como en transcriptómica. Nuestro objetivo es la identificación de genes implicados en condiciones psiquiátricas y el desarrollo de nuevos enfoques en medicina traslacional, como en los siguientes proyectos: – Combinación de análisis de ligamiento con secuenciación del exoma en una gran cohorte de familias bipolares multiplexadas que identificaron un pico de ligamiento (puntuación LOD > 3) en el cromosoma 10q11-q21, que se explica por variantes codificantes patógenas raras, incluyendo aquellos del gen ANK3, cuya asociación con el trastorno bipolar está respaldada por datos de estudios de asociación genómica a nivel genómico (GWAS). Este enfoque demostró ser un método eficaz para el descubrimiento génico en trastornos complejos. – Análisis diferencial de expresión génica y análisis de redes génicas utilizando datos de RNAseq de pacientes bipolares y familiares no afectados señalaron vías desreguladas validadas por asociaciones genéticas del GWAS del Consorcio de Genómica Psiquiátrica. – Estamos investigando si el empalme alternativo a nivel genómico puede desempeñar a nivel global un papel importante en la fisiopatología del trastorno bipolar. Utilizamos diferentes enfoques computacionales para estudiar el empalme alternativo básico y complejo como firma transcriptómica en pacientes bipolares, y revelar posibles isoformas candidatas con un papel en psiquiatría. – Establecimos MadManic, un grupo multidisciplinar dedicado a métodos novedosos para la psiquiatría traslacional con los siguientes objetivos: i) iniciar enfoques pioneros para identificar pacientes psiquiátricos de alto riesgo de conducta suicida mediante inteligencia artificial utilizando tanto datos de monitorización electrónica (dispositivos móviles) como puntuaciones individuales de riesgo poligénico (PRS); ii) Identificar patrones relacionados con la respuesta a tratamientos farmacológicos a través de la farmacogenómica y la farmacotranscriptómica en el trastorno bipolar. – Recientemente establecimos una gran cohorte de pacientes psiquiátricos y controles que contribuirán a los esfuerzos de consorcios globales, avanzando en nuestro conocimiento: i) en la genética implicada en el trastorno bipolar, el suicidio y la esquizofrenia; ii) en la farmacogenómica del litio; iii) en los resultados clínicos y presentaciones del trastorno bipolar.
Esta campaña funciona bajo el modelo Todo o Nada. Solo se realizará el cobro de las aportaciones si se alcanza el objetivo de financiación. Las recompensas serán gestionadas directamente por el promotor del proyecto.
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